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Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  34 lines
  1. ***************************************
  2. * L-lactate dehydrogenase active site *
  3. ***************************************
  4.  
  5. L-lactate dehydrogenase (EC 1.1.1.27) (LDH) [1]  catalyzes  the  final step in
  6. anaerobic glycolysis,  the reduction of L-lactate to pyruvate. This tetrameric
  7. enzyme  is present  in  prokaryotic  and  eukaryotic organisms. In vertebrates
  8. there are  three  isozymes of LDH:  the M form (LDH-A), found predominantly in
  9. muscle tissues; the H form (LDH-B), found in heart muscle and the X form (LDH-
  10. C), found  only  in the  spermatozoa of  mammals  and  birds.   In  birds  and
  11. crocodilian eye lenses, LDH-B serves  as  a structural protein and is known as
  12. epsilon-crystallin [2].
  13.  
  14. L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase (EC 1.1.1.-) (L-hicDH) [3]  catalyzes the
  15. reversible and stereospecific  interconversion  between 2-ketocarboxylic acids
  16. and L-2-hydroxy-carboxylic acids. L-hicDH is evolutionary related to LDH's.
  17.  
  18. As a signature for LDH's we have  selected  a region that includes a conserved
  19. histidine which is essential to the catalytic mechanism.
  20.  
  21. -Consensus pattern: [LIVMA]-G-[EQ]-H-G-[DN]-[ST]
  22.                     [H is the active site residue]
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25. -Last update: May 1991 / Pattern and text revised.
  26.  
  27. [ 1] Abad-Zapatero C., Griffith J.P., Sussman J.L., Rossmann M.G.
  28.      J. Mol. Biol. 198:445-467(1987).
  29. [ 2] Hendriks W., Mulders J.W.M., Bibby M.A., Slingsby C., Bloemendal H.,
  30.      de Jong W.W.
  31.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85:7114-7118(1988).
  32. [ 3] Lerch H.-P., Frank R., Collins J.
  33.      Gene 83:263-270(1989).
  34.